植物的分类依据是花部特征（如花冠、萼片及排列，雄蕊个数，及子房、胚珠），以及果实类型。

合理的解释是，生殖器官在植物的生活史当中出现的时间短，很好地保持了原有的性状。

我们都知道，物竞天择适者生存，生物的任何性状都需要适应环境，也会因环境而被选择、改变。相似的环境下，不同物种的性状也会逐渐趋向相同。而越是出现时间短暂的器官，受到的影响越小，越能反映出亲缘关系，因此在植物分类中，重要的依据是生殖器官的特征。

植物一般是由根、茎、叶、花、果实、种子六大器官构成，其中根、茎、叶是营养器官，花、果实、种子是生殖器官。

因为营养器官更易受外界环境影响，变异大，而生殖器官受外界环境影响相对较小，变异小，可以较准确地反映出植物物种间的进化、亲缘关系。

所以一般用生殖器官作为植物的分类依据。

而被子植物的种子包于果皮之内，一般需经解剖才能观察得到，而且亲缘关系相近的植物之间种子的形态差异很小，很难作为分类依据。

所以植物分类中一般以花和果实作为主要依据。

现代的植物分类法是采用自然分类法，这种分类方法以植物的外部形态为分类依据，以植物之间的亲疏程度作为分类的标准。

判断亲疏的程度，是根据植物之间相同点的多少，如小麦与水稻有许多相同点，于是就认为它们比较接近，而小麦与甘薯、大豆相同的地方较少，于是就认为它们比较疏远。

这样的分类方法就叫做自然分类法。

这样的分类系统，就是自然分类系统。

从进化学说得知，类型众多的植物种类，实际上是大致同源的。

物种之间相似程度的差别，能够显示出它们亲缘关系上的远近。

例如，小麦与水稻之所以比较接近，是由于它们有一个年代较近的共同祖先，而小麦与甘薯、大豆比较疏远，是由于它们有一个年代较远的共同祖先。

木本植物:乔木类主干明显而直立。如白玉兰、悬铃木等。

灌木类无明显主干,一般植株较矮小,分枝以接近地面的节上开始呈丛生状。如栀子花、牡丹等。

藤本类茎木质化,长而细软,不能直立,需缠绕或攀援其他物体才能向上生长。